نظرا لأن الكربون المنشط لديه متطلبات عالية للمعالجة المسبقة للمياه ، وسعر الكربون المنشط مكلف ، في معالجة مياه الصرف الصحي ، يستخدم الكربون المنشط بشكل أساسي لإزالة الملوثات النزرة في مياه الصرف الصحي لتحقيق الغرض من التنقية العميقة. تتم معالجة مياه الصرف الصحي الزيتية من المصفاة أولا عن طريق فصل الزيت وتعويم الهواء والمعالجة البيولوجية ، ثم المعالجة المتقدمة عن طريق ترشيح الرمال وترشيح الكربون المنشط. انخفض محتوى الفينول في مياه الصرف الصحي من 0.1 ملغ / لتر (بعد المعالجة البيولوجية) إلى 0.005 ملغ / لتر ، وانخفض محتوى السيانيد من 0.19 ملغ / لتر إلى 0.048 ملغ / لتر ، وانخفض COD من 85 ملغ / لتر إلى 18 ملغ / لتر.